ヤギッパ登場ステージ：ケロッパの城下町、剣と魔法の研究員、巨人作業員伝説
「メェ〜」と鳴きながら、決まった場所を往復しているヤギ。
どんな攻撃でも倒せるが、相手にしないで通り過ぎてもいい。
クラッシュ・バンディクー３の敵キャラ
ヤギッパ
登場ステージ：ケロッパの城下町、剣と魔法の研究員、巨人作業員伝説
「メェ〜」と鳴きながら、決まった場所を往復しているヤギ。
どんな攻撃でも倒せるが、相手にしないで通り過ぎてもいい。
ケロッパ
登場ステージ：ケロッパの城下町、剣と魔法の研究員、巨人作業員伝説
水辺をピョンピョン跳ね回るカエル。着地したときに攻撃しよう。
実は悪い魔法使いにカエルに変えられた王様で、魔法を解くために強引にキスを狙っている。
バーサーカー研究員
登場ステージ：ケロッパの城下町、剣と魔法の研究員、巨人作業員伝説
でっかい剣を振り回し、クラッシュを真っ二つに切り裂こうとする研究員。
剣が重すぎるのか、一回転すると疲れて休む。その時が攻撃のチャンス。
アトランシャーク
登場ステージ：海底宝探し、海底のうずうずマシーン
ゆっくりと左右に移動している巨大なサメ。
ディープアップルでダッシュ中は操作が効きにくく、コイツにぶつかりやすいので注意。
クサリつき機雷
登場ステージ：海底宝探し、海底のうずうずマシーン
クラッシュのいる方にゆっくりと近づいてくる機雷。クサリにつながれているので一定範囲内しか動けない。
よく引き付けてから、上か下をくぐって避けよう。クサリ部分には触っても大丈夫。
プクット
登場ステージ：海底宝探し、海底のうずうずマシーン
上下に移動しているハリセンボンのような敵。
時々プクーッとふくらんでハリを出し、この時に触るとやられてしまう。
ウツボン
登場ステージ：海底宝探し、海底のうずうずマシーン
岩穴に住む凶暴なウツボで、ヌーッと顔を出してきてガブッと噛み付く。
スピンアタックでやっつけるか、反対側の壁に沿って泳ぎ去ってしまおう。
つんジャイナ作業員
登場ステージ：万里の超特急、月夜の超特急
重そうにブロックを持ち上げている作業員。
ただそこにいるだけなので、左右に避けるか、ジャンプで軽くかわせる。
萬歳龍（バンザイ・ロン）
登場ステージ：万里の超特急、月夜の超特急
突然現れて通路を横切っていく巨大な竜。
低い位置を飛ぶヤツはジャンプ、高い位置を飛ぶヤツは下をくぐり抜けて避けよう。
はねチャイナ作業員
登場ステージ：万里の超特急、月夜の超特急
見張り台の前で、板の裏に隠れている作業員。
板の上に乗ると、ビヨヨ〜ンと大きく跳ねて、見張り台の上に乗ることができる。
棒術研究員
登場ステージ：万里の超特急、月夜の超特急
体に鎧をまとった強そうな研究員。手に持った棒をクルリと回して邪魔をする。
基本的にはつんジャイナ作業員と同類だが、棒の攻撃範囲はけっこう広いので、あなどれない。
ドタバタトプス
登場ステージ：どたばたジュラシック沼、ベイビーＴで突っ走れ！
どたばたと地響きを立てながらクラッシュを追いかけるトリケラトプス。
その巨体で箱を壊してくれるので、コイツに追いかけられるルートでは箱の多少の取りこぼしは大丈夫。
バサバサプテラ
登場ステージ：どたばたジュラシック沼、ベイビーＴで突っ走れ！、発見！探検ベイビーＴ
追いかけられルートにいるプテラノドン。倒すこともできるが、そのまま通過するのが安全。
黄色ダイヤコースにいる２匹目のバサバサプテラにわざと捕まると・・・。
ウェーブ研究員
登場ステージ：どたばたジュラシック沼、ベイビーＴで突っ走れ！
頭だけ水面に出し、クラッシュが近づくと突然覆いかぶさってくる。
倒さずにそのまま通り過ぎると、かなりむなしいヤツ。
ドクロ爆弾
登場ステージ：海賊島を目指せ！、ゴーゴーココマリン、カリブの海は真っ赤っか、発見！カリブの大事件
水面に浮かんでいるものと、海賊船の大砲から撃ち出されるものがある。
カリブ海のステージでは、最も注意しなければいけない敵と言える。
ボートの海賊作業員
登場ステージ：海賊島を目指せ！、ゴーゴーココマリン
ボートに乗って一定の場所を移動する、眼帯をつけた、いかにも海賊らしい作業員。
ジャンプ台を使って上から体当たりすると倒せる。
ジョナタン
登場ステージ：海賊島を目指せ！、ゴーゴーココマリン
時々箱の上にとまって休んでいるカモメ。
ジョナタンが箱の上にとまっているときに箱を壊そうとすると、つつかれてしまう。
ハングリーライオン
登場ステージ：剣闘士タイニータイガー
タイニータイガー戦で、５つの穴から群れを成して走ってくる腹ぺこライオン。
とにかくドンドン出てくるので、左右に避けつつ、噛み付かれそうになったらスピンで撃退しよう。
魔法研究員
登場ステージ：剣と魔法の研究員、巨人作業員伝説
杖から追尾機能付きの光線を出す。スピンアタックで光線を消しながら近づこう。
リンゴバズーカで攻撃すると、服が脱げてパンツ一丁の哀れな姿になる。
サーベル作業員
登場ステージ：アラビアの熱いぶらさがり、アラビアの熱帯夜、燃えろ！アラビアンナイト
歩きながら剣をブンブン振り回す作業員。後ろを向いたときを見計らって攻撃しよう。
その場からは動かず、剣を投げてくるヤツもいる。こちらはジャンプで剣を避けつつ近づいていこう。
魔法のカーペット研究員
登場ステージ：アラビアの熱いぶらさがり、アラビアの熱帯夜
魔法のカーペットに乗ってフワフワと浮いている研究員。
動きは大して速くないので、倒すのも簡単。
サカサソリン
登場ステージ：アラビアの熱いぶらさがり、アラビアの熱帯夜
金網に逆さに張りついて、決められた区間を移動しているサソリ。
近づいてきたところをスピンで攻撃するか、無視して通り過ぎてしまおう。
オットトウータン
登場ステージ：アラビアの熱いぶらさがり、アラビアの熱帯夜、燃えろ！アラビアンナイト
たくさんの壺をかかえてフラフラしているオランウータン。
スピンで攻撃すると、壺が頭にかぶさって、こっけいな姿になる。スライディングなら一撃で倒せる。
エンスー作業員
登場ステージ：荒野のキメキメハイウェイ、地割れのハイウェイをゴー！、クラッシュ取り締まり中
バイクステージで、車に乗ってクラッシュとレースをする。
接触すると、大きく弾かれてタイムロスになってしまう。
パトカー
登場ステージ：荒野のキメキメハイウェイ、地割れのハイウェイをゴー！、クラッシュ取り締まり中、謎の円盤ＵＳＡ
警察のくせにコルテックス印の「Ｎ」マークが描かれた怪しいパトカー。
停車しているもの、左右に動いているもの、コースを逆走してくるものなど、動きは様々。
アカメコブラ
登場ステージ：ピラミッド建設中、まっクラ遺跡探検隊
ズルズルと左右に這って移動している、でっかいヘビ。
体が大きいので、素通りしようとすると逆に危険。スピンアタックか、踏みつけで倒そう。
トビゲーター
登場ステージ：ピラミッド建設中、まっクラ遺跡探検隊
穴の中からいきなり飛び出して、ガブリと噛み付いてくるワニ。
トビゲーターが穴に消えた直後に飛び越すか、タイミングを合わせてスピンアタックを食らわそう。
ペンキー
登場ステージ：ピラミッド建設中、呪いのピラミッド
壺に隠れていて、クラッシュが近づくとペンキを投げてくる。いつも決まって集団で現れる。
スピンで壺を壊すと中からおサルが現れ、頭を踏むとリンゴが最大１０個手に入る。
ギアガチャ作業員
登場ステージ：ピラミッド建設中、呪いのピラミッド
レバーを操作して、天井から石柱を降らせてくる作業員。
作業員自体は全く攻撃せず、クラッシュが近づいてもジーッとこちらを見ているだけ。
エジプトのボワボワ作業員
登場ステージ：ピラミッド建設中、呪いのピラミッド
休みなく左右に火炎放射を続ける作業員。
炎は意外と当たり判定が厳しいので、下手に攻撃するよりも、そのまま通り過ぎるのが無難。
はこんジャイナ作業員
登場ステージ：月夜の超特急
荷物をかついで、画面手前から奥へ移動する。左右にかわすか、ジャンプで跳び越えよう。
ステージ後半になるといっぱい出てきて、かなり邪魔。
クラフィッシュ
登場ステージ：ベイビーＴで突っ走れ！
クラッシュの先祖らしいマヌケ面な魚。だが、スピンアタックの威力はクラッシュよりも上。
ピチピチ跳ねているときだったら、どんな攻撃でも倒すことができる。
ボーボーママ
登場ステージ：アラビアの熱帯夜、燃えろ！アラビアンナイト
窓から顔を出し、火炎瓶を投げつけてくるオバサン。
地面の黒く焦げているところが火炎瓶の落下ポイント。リンゴバズーカさえ手に入れば、楽々倒せる。
伝説の巨人作業員
登場ステージ：巨人作業員伝説
いやに体の大きい作業員。両手に持ったこん棒を交互に振り回して攻撃してくる。
頭が弱点で、踏むとあっけなく倒れる。倒した後おなかに乗るとポンポン弾んで、ちょっと楽しい。
ツッタカ・カーメン
登場ステージ：呪いのピラミッド、まっクラ遺跡探検隊
飛び跳ねながら移動している不気味な棺おけ。
棺おけを壊すと中からミイラ研究員が現れ、うめき声をあげながら辺りをうろつく。
ドッグファイト研究員
登場ステージ：コルテックスの飛行船、撃墜王オレンジバロン、くぐれ！クラッシュ
機関銃を撃ちまくる敵の飛行機。倒しても倒しても無限に現れるので、あまり相手にしないほうがいい。
「くぐれ！クラッシュ」では、レースのライバルとして登場。
コルペリン
登場ステージ：コルテックスの飛行船
コルテックスの顔が描かれた飛行船。飛行船自体は動かないし、攻撃もしない。
弾を当て続けると、リンゴがもらえる。
イカリの海賊作業員
登場ステージ：ゴーゴーココマリン
監視台の上でイカリをブンブン振り回し、攻撃が当たるとゲラゲラ笑うムカつくヤツ。
イカリの動きにあわせて、後を追うようにして避けるのがベスト。
カリブシャーク
登場ステージ：ゴーゴーココマリン、発見！カリブの大事件
水面にヒレを出して泳いでいるサメ。体の色が白く、非常に見えづらい。
動きは前後に移動するだけという単純なものなので、ちょっと左右に回避すれば安全。
ＢＫＢＫ（ビカビカ）
登場ステージ：摩天ロードのベルトウェイ、ハイテク未来でブッぱなせ！
フワフワと宙に浮かび、時々ビカッと光って無敵状態になる。
光っていないときにスピンで倒すか、遠くからリンゴバズーカで狙い撃ちという手もある。
円盤研究員
登場ステージ：摩天ロードのベルトウェイ、ハイテク未来でブッぱなせ！
円盤に乗ってフワフワと浮いている研究員。円盤の側面は熱くて触れることができない。
時々出すビームに注意して下をくぐり抜けるか、ダブルジャンプで踏みつけよう。
メタルニック
登場ステージ：摩天ロードのベルトウェイ、ハイテク未来でブッぱなせ！
２で登場したハリネズミのニックの未来バージョン。ハリを出しているときは危険なので、
ハリを引っ込めたときに攻撃しよう。リンゴバズーカで撃つと、ひっくり返ってしばらく気絶する。
スカラブーン
登場ステージ：恐怖！ナイル川氾濫
水位が上下する場所に出現する、でっかい虫。
水位が低いときは床を這いまわり、水位が上がるとバタバタと羽ばたいて空中を飛びまわる。
トゲトゲミイラ作業員
登場ステージ：恐怖！ナイル川氾濫、まっクラ遺跡探検隊
トゲトゲの棺おけに入ったミイラ作業員。「ギャオー」と叫びながらドッスンドッスン跳ねまわる。
無防備な頭を攻撃するか、空いている場所を走って逃げてしまおう。
エジプトのシールド研究員
登場ステージ：恐怖！ナイル川氾濫
巨大な盾で、クラッシュの攻撃を防ぐ。
通り過ぎようとしても左右に動いて邪魔をするので、スライディングで足を攻撃するしかない。
ＭＴＡＴ（マトアテ）
登場ステージ：ハイテク未来でブッぱなせ！
クラッシュが近づくと、「右→左→右」と３連発でミサイルを撃ってくる巨大なロボット。
ミサイルを撃ち終わると自分から弱点のマトを見せるので、そこをバズーカかジャンプスピンで攻撃！
コルボマー
登場ステージ：撃墜王オレンジバロン
決まったコースを周回しながら飛んでいる巨大な爆撃機。
耐久力が高く、左右両翼にある２基のエンジンを壊さないと撃墜できない。
ピカール
登場ステージ：まっクラ遺跡探検隊
前作同様、暗闇を照らしてくれる親切な虫。
でも、時間がたつと逃げてしまうので、モタモタしている暇はない。
謎の円盤
登場ステージ：謎の円盤ＵＳＡ
夜のハイウェイを走る謎の円盤。空中に浮いているので、地割れも素通りできてしまう。
カクッカクッと素早く動くので、接近しすぎると体当たりを食らって大きく弾かれてしまうことがある。